標準化是建立DNA數據庫的前提及基礎，是建庫的首要環節。DNA數據庫能否成功應用的關鍵是不同實驗室、不同實驗者對同一樣本測試得到的基因型完全一致，否則就不可能為法庭科學提供正確的信息及線索。只有實行標準化及質量控制標準，才能建立高質量的數據庫。建立DNA數據庫的目的是迅速而有效地識別可能逃逸的暴力犯罪嫌疑人，為偵查破案服務，所以它依靠準確無誤的大規模的信息進行查詢比對，從中得到有價值的線索，這就意味著有關數據一旦進入數據庫，幾乎無法糾錯，所以準確性對于建庫至關重要。任何環節有誤均可導致假排除或假認定兩類錯誤，兩種后果都十分嚴重，第一類錯誤可使罪犯逍遙法外，即使再怍案也依然被排除，第二類錯誤可導致錯誤執法，造成冤假錯案而真正的兇手卻逃于法網之外。所以對技術方法的篩選、參數指標的制定、人員及實驗條件的審核、質量保證體系的建立等都是圍繞數據正確這一中心問題。歐美等發達國家在八十年代末就成立了有關DNA檢驗標準化及質量控制方面的機構，負責制定及落實DNA檢驗技術方法標準及質量控制體系。1989年，由歐洲國家警察組織、大學、研究所等機構的實驗室組成的歐洲DNA分型小組（Eurol）ean DNA Profling Group，EDNAP）就已成立，此外，較有影響的國際法醫血液遺傳學會(Intemational Society for Forensic Haemogenetics，ISFH)；美國DNA分析方法技術工作小組(Technical Working Group on DNA Analysis Methods，TWGDAM)等，這些組織對DNA分型技術操作及結果分析等進行標準化規定，使分型結果具有可比性及兼容性。拉丁美洲也成立了DNA分析工作小組(Ibero American Working Group on DNA Analysis，GITAD)聯合19個西班牙語及2個葡萄牙語國家酌DNA試驗室制定了有關DNA分型技術建議或質量保證體系。
英國從開始用單位點探針雜交技術建庫就十分重視質量控制，盡管技術上不斷修訂，但一直把輸入數據正確無誤作為首要工作，建立可操作的嚴格的流程模式并將其制度化，在人員方面對人員進行專門培訓及再訓練，并實行嚴格的淘汰性測試，在樣本采集方面設計專門的工具盒及個人信息記錄表格，制作采樣培訓錄象帶，將所有個人信息由錄入人員錄成一個電子表格，然后輸入到數據庫中并與DNA分型結果相關聯。對樣本存放、DNA提取方法、定量、擴增DNA模板用量、擴增程序、試劑、電泳分析方法、設備等均做了詳盡的規定。等位基因分析由2名操作員獨立進行，并由另一名技術人員處理2套結果間差異，在實驗室取檢測樣本的10%用于盲測，每周還將不完全匹配的樣本進行多至13~ 14個基因座的檢測，以保證等位基因型判讀的準確性。
美國為了保證其CODIS數據庫中的信息準確可信、并具備法律效力，DNA咨詢委員會(DAB)向FBI推薦建立了一套質量保證標準-DNA法庭檢測實驗室質量保證標準。這一套標準已經在1998年10月1日起生效，它規定的范圍很廣，從質量保證程序、組織管理、職員、人員考核、設備、物證控制、分析程序、報告、核查、糾錯、安全等諸多方面對實驗室進行了全面的規定。建庫的質量保證是一種系統性工程，進行DNA法庭檢驗的實驗室必須遵守“DNA法庭檢驗實驗室質量保證標準”。這套標準成為CODIS建庫的質量保證體系的主體。在這個系統中，對實驗室的一些日常行為也有全面的規定。實驗室應該有一份大綱性的質量保證程序文件，并且應該用文件記錄實驗室各種行為，包括各職員的責任、權力、相互關系，建立嚴格的實驗室組織管理；實驗室無關人員不能隨意進入；實驗室的物證要得到很好的保護，保存，及相應的文件記錄和標記。實驗室內所有的實驗操作都經過技術主管研究和書面確立。設備應該保持清潔和監控，在需要的時候要進行校準；所有的實驗報告和文件要完整，并接受復查，以及時發現錯誤并改正。每年都要進行審查，以確認實驗室符合標準規定s在這樣一套標準的保證下，CODIS系統的數據是科學嚴謹、具備法律權威性的。除了遵循DNA檢驗中的贗量保障體系外，在規定建庫的方法和標準后，為了確保入庫數據的準確性，還增加了許多措施，CODIS系統在實驗質檢方面具有代表性，措施如下：1）每批次檢驗，均有已知標準對照，2）每批次樣本有10%以盲測形式進行重復檢驗，3）質量保證工作組每月將5個已知分型結果的樣本混入送檢樣本中，4）每周進行匹配檢查，檢查是否有錯誤命名，5）通過行業外IS09000認證體系進行檢查及審核。只有完全符合上述條件的實驗室才可繼續檢驗，否則將取消資格，直至重新復查合格后方可繼續進行并使用CODIS系統。在大量樣本檢驗、儲存之前，必須制定接觸、檢驗、使用DNA樣本及DNA數據庫的法律條文及相應的處罰條例，以防止錯用和濫用DNA數據庫的資料。州及地方實驗室進入CODIS系統也有嚴格的條例規定，受到聯邦韻限锘iJ，這既是保密的需要，也是質量控制的需要。為了加速DNA建庫，不斷增加CODIS系統在調查犯罪方面的應用價值，FBI主動與州及地方實驗室合作，支持州及地方立法同意DNA建庫，由FBI提供計算機及分析軟件和網絡服務，并通過培訓及技術支持將FBI認為成熟、行之有效的檢驗方法及標準傳授給州及地方實驗室，以加速CODIS泵統的建立，擴充CODIS系統的數據及信息。
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