DNA數據庫收集哪些樣本，直接關系到數據庫發揮作用的大小，國外許多國家以立法形式確定。基于法律、道德、人權及財力等方面的考慮，不同國家、地區有一定區別。據統計許多重大、惡性案件的罪犯均有犯罪前科，例如，美國有62%的暴力案犯釋放后會重新作案。可見建立前科庫具有十分重要的意義。英國建立的DNA犯罪數據庫前科庫主要為三 種對象：(1)夜間盜竊者；(2)性犯罪；(3)暴力犯罪。但若偵查需要，警察也可提供其他有違法記錄者的樣本。因其他犯罪而被監禁者，警察如懷疑其犯有上述三類罪行之一，同樣可以提取其生物檢材。警察在理解這三類犯罪方面也有寬松余地，如偷盜婦女內衣，預示其可能進行惡性性犯罪，雖然指控只是偷盜，但獲取這類案犯的DNA數據入庫十分有價值，因而可以提取其樣本進行DNA分析，另外，吸毒犯罪往往與惡性暴力案件有關，FSS建議應提取這類罪犯的樣本建庫。對于法案中規定的罪犯，警方可以強制取樣，從而保證警察取樣的合法性。但英國法律同時規定提取體內樣本只有在供方同意的情況下方可提取，針對這一限制，新法案對體內樣本進行了重新定義，拔取毛根（每次至少10根）及提取口腔拭子不被認為是體內樣本，并規定樣本不夠時，警察可以重新取樣，這一規定對以PCR為基礎的分析方法來講，樣本可以滿足DNA分析之需要。樣本采集由相關警察局組織實施，包括填寫條形碼或個人資料表格，提取樣本（每個個體2份），包裝、送檢。FSS為此專門生產了樣本提取專用試劑盒、提取拭子、條碼試管、個人資料記錄表格，并錄制了試劑盒及樣本提取培訓錄象，從而保證所提取祥本不受污染，保證所送檢樣本的真實性。
美國CODIS系統原則上以各種暴力犯罪為建庫對象，盡管各州法案條款規定不盡相同，但都包括色情性犯罪者，CODIS系統主要包括四類DNA樣本分析數據：(1)案件現場生物檢材分型結果；(2)各州法律規定可錄取的犯人DNA分型結果；(3)無名尸體及失蹤者親屬樣本DNA分型結果；(4)以統計分析為目的的群體樣本數據。根據各州法律不同，可以提取血液、唾液、毛發。其他已建庫的國家，在建庫對象及樣本采集方面大都參照FSS的方法。FBI對取證時的采集方法、送交、保存、編號、記錄等程序都有嚴格的規定，這也成為數據庫質量保證體系的重要組成部分。在“FBI法庭服務手冊”中規定，DNA證據可以從血液、血跡、精液、精斑、唾液、尿液、頭發、組織、骨頭、牙齒中取證。取證時要根據物證的特點，遵照手冊中有關程序，做到最有效取證、盡量不污染物證和破壞物證原始狀態。物證在提交給實驗室前的保管和包裝，也是按照根據物證的形態所制訂的一系列程序進行的。DNA的同時，還要把相同條件的空白對照交給實驗室。這樣的取證程序同樣是為了保證DNA數據的完整性、法律權威性。
對于目前使用的PCR技術而言，只耍微量（pg~ ng水平）的DNA足以進行擴增分型，所以不論是取口腔拭子還是毛根或取血紗都可作為建庫樣本，只是對采集方法、程序、送檢、保存、編號、記錄等必須詳盡，必須有嚴格的規定，以防出現樣本污染或其他不應有的差錯。
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